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python 生物 热图

管理员 2023-06-26 08:31:45 软件开发 11 ℃ 0 评论 1193字 收藏

python 生物 热图

Python在生物学领域有着广泛的利用,其中热图是经常使用的数据可视化方式之一。热图可以用来展现基因表达、蛋白质互作、药物作用等各种生物数据。

下面是使用Python绘制热图的示例代码:

import seaborn as sns
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
# 读取数据
df = pd.read_csv("gene_expression.csv")
# 绘制热图
sns.heatmap(df, cmap="YlGnBu")
# 添加标题和标签
plt.title("Gene Expression Heatmap")
plt.xlabel("Samples")
plt.ylabel("Genes")
# 显示图象
plt.show()

代码中使用了Seaborn和Pandas库来读取数据和绘制热图。首先,我们读取了一个名为gene_expression.csv的数据文件。接着,我们使用Seaborn的heatmap()函数来生成热图。cmap参数可以指定色彩映照,此处使用YlGnBu(黄-绿-蓝)色系。

最后,我们添加了标题和标签,并使用Matplotlib的show()函数来显示图象。

热图对生物学研究非常有用,它可使得数据处理和分析更直观、更容易懂。Python提供了丰富的数据处理和可视化工具,让生物学家能够轻松地探索和理解数据。

文章来源:丸子建站

文章标题:python 生物 热图

https://www.wanzijz.com/view/59471.html

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